Le 3 septembre 1999, une onzième ligne est créée : la N33. Elle dessert les quartiers de Malagnou, Sous-Moulin et Moillesulaz.
Le 27 septembre 1999, l’Assemblée générale de la Commission Noctambus approuve une réorganisation de sa structure interne et décide d’effectuer un service de transport nocturne durant l’été.
Le 1er octobre 1999, la ligne N1 est renforcée par une course supplémentaire le samedi soir. De plus, la N10 est prolongée jusqu’à Gland, intégrant ainsi six communes vaudoises supplémentaires.
Le 16 octobre 2000, la ligne N9 est prolongée jusqu’à Ferney-Voltaire. Le Noctambus circulera donc sur France ! La N10 est renforcée par une course supplémentaire le vendredi soir.
Le 24 juin 2001, le réseau Noctambus est encore renforcé par la création d’une ligne N11 qui se rend à Bogis-Bossey, la N8 est prolongée jusqu’à Saint-Genis et certaines lignes voient leur nombre de courses augmenter. De plus, en partenariat avec Pathé Balexert, une ligne relient le centre commercial au centre-ville est mise en service.
Le 6 janvier 2002, l’Etat de Genève participe financièrement au réseau Noctambus. Cette participation a permis au Noctambus d’ajouter une nouvelle course le vendredi soir pour les lignes N1, N3, N4, N5, N9 et N11.
Dès le 31 mars 2003, la participation financière de l’Etat de Genève s’intensifie et permet d’accepter les abonnements unireso. Désormais, environ 90% des usagers Noctambus pourront voyager sans frais, sous présentation de l’abonnement. Par ailleurs, l’offre Noctambus est intégrée à celle des TPG (Transports publics genevois), ce qui marque une phase de pérennisation du réseau nocturne.
Le 3 septembre 1999, une onzième ligne est créée : la N33. Elle dessert les quartiers de Malagnou, Sous-Moulin et Moillesulaz.
Le 27 septembre 1999, l’Assemblée générale de la Commission Noctambus approuve une réorganisation de sa structure interne et décide d’effectuer un service de transport nocturne durant l’été.
Le 1er octobre 1999, la ligne N1 est renforcée par une course supplémentaire le samedi soir. De plus, la N10 est prolongée jusqu’à Gland, intégrant ainsi six communes vaudoises supplémentaires.
Le 16 octobre 2000, la ligne N9 est prolongée jusqu’à Ferney-Voltaire. Le Noctambus circulera donc sur France ! La N10 est renforcée par une course supplémentaire le vendredi soir.
Le 24 juin 2001, le réseau Noctambus est encore renforcé par la création d’une ligne N11 qui se rend à Bogis-Bossey, la N8 est prolongée jusqu’à Saint-Genis et certaines lignes voient leur nombre de courses augmenter. De plus, en partenariat avec Pathé Balexert, une ligne relient le centre commercial au centre-ville est mise en service. 
Le 6 janvier 2002, l’Etat de Genève participe financièrement au réseau Noctambus. Cette participation a permis au Noctambus d’ajouter une nouvelle course le vendredi soir pour les lignes N1, N3, N4, N5, N9 et N11.
Dès le 31 mars 2003, la participation financière de l’Etat de Genève s’intensifie et permet d’accepter les abonnements unireso. Désormais, environ 90% des usagers Noctambus pourront voyager sans frais, sous présentation de l’abonnement. Par ailleurs, l’offre Noctambus est intégrée à celle des TPG (Transports publics genevois), ce qui marque une phase de pérennisation du réseau nocturne.